Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm42651-201ENSMUST00000199851 1339 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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PdgfaP20033 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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PdgfaP20033 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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PdgfaP20033 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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PdgfaP20033 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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PdgfaP20033 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
PdgfaP20033 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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