Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtcP11725 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtcP11725 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtcP11725 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtcP11725 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtcP11725 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtcP11725 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtcP11725 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtcP11725 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtcP11725 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtcP11725 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtcP11725 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtcP11725 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtcP11725 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtcP11725 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtcP11725 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtcP11725 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtcP11725 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OtcP11725 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
OtcP11725 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OtcP11725 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OtcP11725 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OtcP11725 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OtcP11725 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OtcP11725 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OtcP11725 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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OtcP11725 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OtcP11725 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OtcP11725 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
OtcP11725 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OtcP11725 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OtcP11725 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
OtcP11725 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
OtcP11725 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OtcP11725 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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OtcP11725 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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OtcP11725 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OtcP11725 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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OtcP11725 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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OtcP11725 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OtcP11725 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OtcP11725 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OtcP11725 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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OtcP11725 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OtcP11725 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OtcP11725 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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OtcP11725 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OtcP11725 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OtcP11725 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OtcP11725 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OtcP11725 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OtcP11725 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OtcP11725 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OtcP11725 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OtcP11725 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OtcP11725 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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OtcP11725 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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OtcP11725 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
OtcP11725 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OtcP11725 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
OtcP11725 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
OtcP11725 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
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