Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Col5a1O88207 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 2610318N02Rik-202ENSMUST00000207116 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Col5a1O88207 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm16538-201ENSMUST00000162407 442 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Col5a1O88207 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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