Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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BckdkO55028 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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BckdkO55028 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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BckdkO55028 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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BckdkO55028 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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BckdkO55028 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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BckdkO55028 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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BckdkO55028 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
BckdkO55028 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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