Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
E2f6O54917 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms