Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rab33bO35963 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab33bO35963 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms