Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Edil3O35474 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Edil3O35474 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms