Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ColqO35348 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ColqO35348 1810026B05Rik-201ENSMUST00000183916 432 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ColqO35348 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm38177-201ENSMUST00000192213 1040 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm37989-201ENSMUST00000195202 803 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ColqO35348 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ColqO35348 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ColqO35348 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
ColqO35348 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm18043-201ENSMUST00000216741 739 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ColqO35348 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ColqO35348 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
ColqO35348 AC154603.2-201ENSMUST00000223896 577 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ColqO35348 AC124729.1-202ENSMUST00000225587 938 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
ColqO35348 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ColqO35348 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ColqO35348 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ColqO35348 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
ColqO35348 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ColqO35348 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ColqO35348 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ColqO35348 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
ColqO35348 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Olfr700-202ENSMUST00000214840 1505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 E330011O21Rik-204ENSMUST00000210839 1361 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm12460-201ENSMUST00000117147 357 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm11278-201ENSMUST00000121002 997 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm14582-201ENSMUST00000141697 1189 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 2610016A17Rik-203ENSMUST00000188711 515 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 4933436E23Rik-201ENSMUST00000192824 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Ighv8-1-201ENSMUST00000194897 291 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm18255-201ENSMUST00000211316 765 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 AC153955.1-201ENSMUST00000217458 663 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 AC187103.3-201ENSMUST00000225725 646 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 AC134335.1-201ENSMUST00000227626 329 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Olfr1113-201ENSMUST00000079966 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ColqO35348 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ColqO35348 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
ColqO35348 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ColqO35348 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms