Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
MttpO08601 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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MttpO08601 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
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MttpO08601 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
MttpO08601 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
MttpO08601 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms