Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

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Length 267 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Gm2888K7N746 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Gm2888K7N746 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm2888K7N746 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm2888K7N746 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Gm2888K7N746 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Gm2888K7N746 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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