Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc180J3QNE4 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc180J3QNE4 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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