Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Gm3727J3QM54 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms