Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
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Gm21818J3KMS6 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm21818J3KMS6 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm21818J3KMS6 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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