Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm20828J3KMI7 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm20828J3KMI7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms