Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

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Length 710 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Zfp408H7BX78 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Zfp408H7BX78 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Zfp408H7BX78 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Zfp408H7BX78 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Zfp408H7BX78 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Zfp408H7BX78 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zfp408H7BX78 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Zfp408H7BX78 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Zfp408H7BX78 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Zfp408H7BX78 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Zfp408H7BX78 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Zfp408H7BX78 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Zfp408H7BX78 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Zfp408H7BX78 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Zfp408H7BX78 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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