Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm28048F7BCN0 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm28048F7BCN0 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
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Gm28048F7BCN0 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm28048F7BCN0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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