Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm829-201ENSMUST00000123741 465 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm13624-201ENSMUST00000120263 462 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Plec-206ENSMUST00000074834 14855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Cfap46E9Q2C0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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