Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 BC106175-201ENSMUST00000218578 695 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Trappc8E9PWG2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms