Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm3298E9PW80 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm3298E9PW80 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm3298E9PW80 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm3298E9PW80 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm3298E9PW80 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm3298E9PW80 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm3298E9PW80 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm3298E9PW80 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm3298E9PW80 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm3298E9PW80 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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