Protein–RNA interactions for Protein: E9PVU2

4931429L15Rik, RIKEN cDNA 4931429L15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931429L15RikE9PVU2 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
4931429L15RikE9PVU2 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms