Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rnf217D3YYI7 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Rnf217D3YYI7 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rnf217D3YYI7 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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