Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Uhrf1bp1B2KF50 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms