Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Spocd1B1ASB6 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Spocd1B1ASB6 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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