Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Scn3aA2ASI5 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Scn3aA2ASI5 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Scn3aA2ASI5 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Scn3aA2ASI5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Scn3aA2ASI5 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Scn3aA2ASI5 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
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Scn3aA2ASI5 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn3aA2ASI5 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn3aA2ASI5 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn3aA2ASI5 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn3aA2ASI5 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn3aA2ASI5 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn3aA2ASI5 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn3aA2ASI5 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Scn3aA2ASI5 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn3aA2ASI5 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn3aA2ASI5 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn3aA2ASI5 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn3aA2ASI5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn3aA2ASI5 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn3aA2ASI5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn3aA2ASI5 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn3aA2ASI5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn3aA2ASI5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn3aA2ASI5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn3aA2ASI5 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn3aA2ASI5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Scn3aA2ASI5 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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