Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ25

Skt, Sickle tail protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SktA2AQ25 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SktA2AQ25 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms