Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ckap5A2AGT5 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms