Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC7□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC7□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
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