Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm3550W4VSN7 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms