Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nek4Q9Z1J2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek4Q9Z1J2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek4Q9Z1J2 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek4Q9Z1J2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek4Q9Z1J2 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek4Q9Z1J2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek4Q9Z1J2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek4Q9Z1J2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek4Q9Z1J2 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek4Q9Z1J2 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek4Q9Z1J2 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek4Q9Z1J2 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nek4Q9Z1J2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek4Q9Z1J2 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek4Q9Z1J2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek4Q9Z1J2 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek4Q9Z1J2 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek4Q9Z1J2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nek4Q9Z1J2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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