Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Psmb3Q9R1P1 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Psmb3Q9R1P1 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms