Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sh2d3cQ9QZS8 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms