Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hmgn5Q9JL35 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms