Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Chrac1Q9JKP8 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Chrac1Q9JKP8 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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