Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Trim39Q9ESN2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Trim39Q9ESN2 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Trim39Q9ESN2 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Trim39Q9ESN2 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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