Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tlr1Q9EPQ1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms