Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hmgn3Q9DCB1 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hmgn3Q9DCB1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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