Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Smg9Q9DB90 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Smg9Q9DB90 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Smg9Q9DB90 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Smg9Q9DB90 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Smg9Q9DB90 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
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