Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Pdzd9Q9D9M4 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdzd9Q9D9M4 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Pdzd9Q9D9M4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Pdzd9Q9D9M4 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Pdzd9Q9D9M4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Pdzd9Q9D9M4 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Pdzd9Q9D9M4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdzd9Q9D9M4 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms