Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Derl3Q9D8K3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms