Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Cldn22Q9D7U6 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms