Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Srp19Q9D7A6 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Srp19Q9D7A6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 241 ms