Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Borcs6Q9D6W8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms