Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Ccdc7Q9D541 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccdc7Q9D541 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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