Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PrameQ9D4Z5 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PrameQ9D4Z5 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PrameQ9D4Z5 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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PrameQ9D4Z5 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
PrameQ9D4Z5 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
PrameQ9D4Z5 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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