Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

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Length 321 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Fndc8Q9D2H8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
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Fndc8Q9D2H8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Fndc8Q9D2H8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Fndc8Q9D2H8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Fndc8Q9D2H8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms