Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm15881-201ENSMUST00000148792 942 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pramef12Q9D2F1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms