Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Trappc6bQ9D289 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms