Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Spns3Q9D232 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms