Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Mrpl53Q9D1H8 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms