Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmbr1lQ9D1E5 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lmbr1lQ9D1E5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lmbr1lQ9D1E5 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms